System regulacyjny musi zapewniać stabilne i czyste środowisko produkcyjne. Jeśli chodzi o wodę, gaz, sprężone powietrze, gaz obojętny itp., muszą one spełniać wymogi czystości odpowiedniego procesu farmaceutycznego, GMP oraz odpowiednich wytycznych i przepisów. W przemyśle farmaceutycznym woda potrzebna do produkcji jest specjalnie uzdatniana. Aby upewnić się, że instalacja jest czysta lub że proces fermentacji nie zanieczyszcza środowiska, gaz musi zostać wysterylizowany i przefiltrowany.